Les molécules de polymère en caoutchouc de silicone sont des structures en forme de chaîne formées par des liaisons SI-O (silicium-oxygène), et leur composant principal est le polysiloxane linéaire à haute masse molaire. Parce que la liaison Si-O-SI est son type de liaison de base, les atomes de silicium sont principalement liés aux groupes méthyle et une très petite quantité de groupes insaturés sont introduits sur les chaînes latérales.
Les forces intermoléculaires sont petites et les molécules ont une structure hélicoïdale. Les groupes méthyles sont disposés vers l'extérieur et peuvent tourner librement, ce qui fait que le caoutchouc de silicone a une meilleure résistance à la chaleur, une isolation électrique, une stabilité chimique, etc. que les autres caoutchoucs courants.
Le caoutchouc de silicone typique, à savoir le siloxane polydiformaldéhyde, a une configuration moléculaire hélicoïdale avec des forces intermoléculaires relativement petites, possédant ainsi une excellente résilience. Pendant ce temps, les groupes de formaldéhyde pointant à l'extérieur de l'hélice peuvent tourner librement, ce qui assure le caoutchouc de silicone avec des propriétés de surface uniques telles que l'hydrophobicité et la surface anti-adolescente